Kunitz ehti pelata Atlanta Thrashersissa ainoastaan kaksi runkosarjaottelua ennen kuin seura asetti miehen waivers-listalle.
Kunitz kuului vielä kesällä Mighty Ducksin pelaajarinkiin ja hän pelasi viisi harjoitusottelua joukkueen kokoonpanossa. Mighty Ducks kuitenkin laittoi Kunitzin waivers-listalle lokakuun 4. päivä. Tällöin Thrashers nappasi miehen listalta.
Kuluneen kauden Thrashers-otteluissa 26-vuotias Kunitz jäi ilman pisteitä. Viime kaudella kanadalaishyökkääjä saalisti Mighty Ducksin farmijoukkueessa Cincinnati Mighty Ducksissa 39 pistettä 54 ottelussa. Kaudella 2003-04 Kunitz esiintyi Mighty Ducksin NHL-kokoonpanossa 21 ottelussa tehoin 0+6.